新鲜百合放在低温干燥、隔绝污染的环境下存放不容易坏，可根据计划的存放时长选择合适的存放方式。
1、冰箱冷藏（适合1-2周内吃完的短期存放）：先把新鲜百合表面已经坏掉、发软的瓣去掉，不用清洗，用干燥的厨房纸整个包裹起来，再装入保鲜袋，在保鲜袋上扎2-3个小孔透气，放进冰箱冷藏室即可，这种方法能保留百合新鲜脆嫩的口感。
2、冰箱冷冻（适合3-6个月的长期存放）：新鲜百合完全可以放冰箱冷冻保存，反而比常温存放更不容易坏，保质期更长。处理的时候把百合掰成小瓣清洗干净，开水下锅焯1分钟左右捞出过凉水，彻底控干表面水分后装进密封保鲜盒，放进冰箱冷冻层即可，吃的时候不用解冻直接烹饪就行，风味几乎不受影响。
3、沙土干藏（适合没有冰箱、需要存放1-3个月的情况）：准备干净干燥的细沙土，把完整无损伤的新鲜百合表皮擦干，一层沙土一层百合埋进纸箱里，放在室内阴凉通风的地方，每次吃的时候拨开沙土取出来再封好就行。
存放时尽量选择完整无损伤的百合，已经发霉发黑的百合要直接扔掉，不要食用，大家根据自己能吃完的时间选对应方法就可以。