自己种的芹菜发苦，主要是品种特性、种植管理不当或采收不及时造成的，属于正常的品质变化，不是有毒变质。
1、品种特性本身带苦。很多农家自留的老品种芹菜，本身就含有比改良品种更多的苦味糖苷，天生苦味就比较明显，而且越是靠近根部和叶片的位置，苦味会越重。
2、种植不当会加重苦味。种植过程中如果持续高温干旱、土壤缺肥，芹菜会合成更多苦味物质来抵御逆境；种植密度太大缺光、浇水过多烂根，或是采收过晚芹菜老化，纤维增多的同时苦味也会大幅上升。
3、发苦的自种芹菜可正常食用。只要芹菜没有出现腐烂、发霉、病变发黑的情况，发苦的芹菜完全可以吃，苦味来自天然的植物成分，本身没有毒性，吃前放沸水中焯1分钟，就能去掉大部分苦味。
如果介意芹菜发苦，下次种植可以选改良的淡味西芹品种，生长期保持水肥均匀，植株长到合适大小及时采收，就能种出脆嫩低苦的芹菜。