百合发酸主要是品种特性、硫磺熏蒸加工或变质发霉三种原因导致，并非所有百合发酸都属于正常情况。
1、除了少数未完全改良的食用品种本身自带微弱酸感外，绝大多数商品食用百合本身是清甜口感，发酸大多是异常情况：干百合加工时常用硫磺熏蒸提亮卖相、延长保质期，硫磺和百合中的成分反应后会留下明显的酸感；新鲜或干百合受潮变质后，微生物分解内部养分也会产生发酸的异味。
2、如果是品种本身自带的淡酸，百合没有发霉、变色、腐臭等异常状态，这种发酸的百合可以正常吃，只是风味不如常见的清甜品种，不会对健康造成影响。
3、如果是硫磺熏蒸或者变质发霉引发的发酸，这类百合都不可以吃：硫磺熏蒸的百合大多存在二氧化硫超标的问题，长期食用会持续损伤呼吸道和肠胃黏膜；变质百合滋生的霉菌毒素，食用后很容易引发腹痛、腹泻、呕吐等急性不适。
买百合时尽量选颜色偏乳黄、闻着只有自然清香味的产品，新鲜百合吃不完要密封冷藏或冷冻，发现异常尽早丢弃。