活银耳要根据预计食用时间选择对应保存方法，短期存放选冷藏密封，长期存放选密封冷冻，最大程度保留新鲜度和口感。
1、短期存放（10天内食用）：先把活银耳表面的浮灰和多余水分轻轻吸干，注意不要提前水洗，装入带少量透气孔的保鲜袋或者密封保鲜盒，放入冰箱0-4℃的冷藏室保存即可，不要和榴莲、葱姜这类重异味食物放在一起，避免串味。
2、长期存放（超过10天食用）：把活银耳按照一次食用的量分成小份，每份用保鲜膜完全密封包裹，避免水分流失和串味，之后放入冰箱-18℃以下的冷冻层保存即可，吃之前提前一晚放到冷藏室解冻，口感基本不会受影响。
3、不同保存方式的存放时长：0-4℃冷藏的活银耳最多可以存放7-10天，超过这个时间很容易变质；-18℃冷冻的活银耳可以存放3-6个月，只要一直保持冷冻状态不会变质；如果是室温存放，夏季只能放1-2天，冬季最多放3-4天，不建议长时间室温存放。
保存活银耳过程中要多观察状态，如果出现发黏、变色、发酸发臭的情况，说明已经变质，直接丢弃不要食用。