新鲜鱿鱼要先去除内脏、墨囊清理干净后，根据想要存放的时长选择冷藏短期保存或是冷冻长期保存，处理合格的新鲜鱿鱼冷藏可放2-3天，冷冻能保存3-6个月。
1、短期冷藏保存：把清理干净的鱿鱼沥干表面水分，用厨房纸巾包裹吸掉多余潮气，再装入密封保鲜袋，排出袋内多余空气后放到冰箱冷藏室，温度保持在0-4℃即可，适合1-3天内就要食用的新鲜鱿鱼。
2、长期冷冻保存：清理好的鱿鱼提前分成一次能吃完的小份，每份分别装入密封保鲜袋，挤出空气后扎紧袋口，放到冰箱冷冻层存放，零下18℃环境下可以保存3-6个月，能最大程度锁住鱿鱼的鲜度和弹性。
3、保存后的新鲜鱿鱼正确解冻：短期冷藏的鱿鱼取出就可以直接加工，冷冻保存的鱿鱼最好提前12小时放到冷藏室缓慢解冻，不要直接泡热水或是长时间放室温，避免鲜味流失和细菌滋生；急用时可以用流动冷水冲淋解冻，不要用热水。
不管是哪种保存方式，都要先清理掉鱿鱼的内脏、墨囊再存放，带杂质保存很容易提前变质，发现保存后的鱿鱼出现发黏、发酸的变质情况，就不要再继续食用了。