爷爷和孙子做亲子鉴定，如果确实存在血缘祖孙关系，确认亲缘关系的准确率可达99.99%以上，排除非亲缘关系的准确率接近100%。
A、爷爷和孙子做的亲子鉴定属于隔代亲缘鉴定，和父母与孩子的直接亲子鉴定不同，它主要通过检测Y染色体的遗传标记来确认关系——Y染色体遵循父系遗传规律，爷爷传给父亲、父亲再传给孙子，同一父系男性的Y染色体序列高度一致。只要位点匹配符合标准，就能给出准确率99.99%以上的肯定结论。
B、爷爷和孙子完全可以做亲子鉴定，只要选对鉴定方法就可以得到准确结果。除了最常用的Y染色体亲缘鉴定，如果爷爷和孙子都能提供合格样本，也可以做全基因组位点比对，进一步提高结果的准确性，满足不同的鉴定需求。
C、若鉴定结果要用于打官司、上户口等司法场景，所有被鉴定人必须到正规鉴定机构现场采样，提供身份证件留证；如果只是个人想知道结果，可以自行采集好毛发、口腔拭子等样本送检，保护个人隐私。
爷爷和孙子做亲子鉴定可以得到较为准确的结果，但如果孩子的父亲还可以参与鉴定，优先选择父亲和孩子做直接亲子鉴定，结果的精准度会更高。