豆芽通过降低存储温度、控制湿度、隔绝空气，可以有效延长保存时间，处理正确最长可存放1个月左右。
1、短时间存放延长保质期的方法：如果1-2天内就会吃，可以先把豆芽里发软、变色的坏豆芽挑出来，把剩下的豆芽摊开铺在阴凉通风处，表面盖一层干净的湿纱布保湿，不要泡在水里，这样能避免豆芽脱水变干或者闷坏。
2、发好的豆芽完全可以放冰箱，冰箱的低温环境能抑制细菌繁殖，还能减缓豆芽自身的呼吸消耗，是延长豆芽保存时间最常用的方法，正确存放不会影响豆芽的食用安全性。
3、想要豆芽在冰箱放得更久，需要做正确的预处理：先把豆芽淘洗干净，彻底沥干表面多余水分，按照每次吃的量分成小份，装进密封保鲜袋后挤掉袋内空气扎紧口，放冷藏室可存3-5天，放冷冻层能存1个月左右，吃的时候无需解冻直接下锅即可。
豆芽本身含水量高、组织脆嫩，存放时间越长口感越软、营养流失越多，建议尽量趁新鲜食用，存放后吃之前要检查有没有发酸发黏的变质情况，变质后就不要吃了。